Khả năng xâm nhập, tồn tại và thích nghi của các tác nhân gây bệnh, chẳng hạn như ký sinh trùng, vi khuẩn, nấm và vi-rút, ở cả vật chủ động vật không xương sống và có xương sống, là đa yếu tố và phụ thuộc vào cả thể trạng của tác nhân gây bệnh và vật chủ.

Đối mặt với các điều kiện căng thẳng do môi trường gây ra và ảnh hưởng đến sự tăng trưởng và phát triển của chúng trong suốt vòng đời, thực vật phải có khả năng nhận biết, xử lý và chuyển đổi các kích thích khác nhau thành các phản ứng thích nghi. Việc hiểu các phản ứng phối hợp của cơ thể liên quan đến việc mô tả chi tiết các cơ chế xảy ra ở cấp độ tế bào và phân tử.